Il museo, ubicato nel seicentesco Collegio dei Gesuiti, comprende tre sezioni: archeologica, in cui sono custoditi i reperti recuperati durante gli scavi effettuati nel territorio salemitano; risorgimentale, che raccoglie cimeli, armi, divise e documenti del periodo risorgimentale e garibaldino; d’arte sacra, in cui sono esposte opere d’arte prelevate da chiese distrutte o danneggiate dal terremoto che colpì la Valle del Belice nel 1968. Tra questi, un fonte battesimale, la Madonna della Candelora in marmo e la Madonna con Bambino in terracotta attribuite allo scultore Domenico Gagini, una quattrocentesca Madonna con Bambino in marmo policromo di Francesco Laurana. La raccolta museale è costituita da opere che abbracciano un arco cronologico che va dall’arte classica a quella moderna, dalle sculture rinascimentali ai dipinti manieristici e barocchi. In un’ala del museo è stata ricreata la Casa della Madonna di Loreto, realizzata nel 1700 dall’architetto amico.